Hallinto
Hallitus
Liiton käytännön toimintaa johtaa hallitus. Hallitukseen kuuluu puheenjohtaja, liittosihteeri ja vähintään kahdeksan sekä enintään kolmetoista muuta varsinaista jäsentä.
Valtuusto
Edustajakokousten välillä ylintä päätösvaltaa käyttää Merimies-Unionin valtuusto. Valtuustoon kuuluu puheenjohtaja ja 14 muuta varsinaista jäsentä. Kullakin varsinaisella jäsenellä on varajäsen.
Valtuusto kokoontuu sääntömääräisiin kokouksiin kaksi kertaa vuodessa, keväällä ja syksyllä. Valtuusto voidaan kutsua koolle myös tarpeen vaatiessa. Jokainen ammattiosasto ja sen jäsen voi tehdä valtuustolle esityksiä.
