Förvaltning
Fullmäktige
Mellan representantskapens möten har Sjömans-Unionens fullmäktige den högsta beslutsmakten. Fullmäktiget består av ordförande och 14 andra ordinarie ledamöter. Varje ordinarie ledamot har en suppleant.
Fullmäktige sammanträder till stadgeenliga möten två gånger om året, på våren och på hösten. Fullmäktige kan kallas även vid behov. Varje fackavdelning och dess medlem kan lämna förslag till fullmäktige.

Styrelse
Förbundets praktiska verksamhet leds av styrelsen. Till styrelsen hör ordförande, förbundssekreterare och minst åtta samt högst tretton andra ordinarie ledamöter.
